Après avoir été éconduit par Yumi, William se donne pour mission de découvrir le secret qu'elle cache. Très vite, il parvient à suivre Ulrich et Odd jusqu'à l'usine et découvre l'existence de Lyoko et Xana. Pendant ce temps, dans le Secteur Glacé, le Scyphozoa prend possession d'Aelita pour qu'elle accède à Code:Xana dans la tour de contrôle, mais elle est dévirtualisée de justesse. Le groupe pense que l'aide de William sera précieuse, lorsqu'un ouvrier de démolition possédé place plusieurs bombes dans l'usine. Ils votent pour décider d'intégrer ou non William à leur groupe, mais Yumi vote contre et Jérémie initie un retour dans le passé.