L'arme vivante de l'ancienne Union soviétique, Omega Red, est décongelée par l'armée américaine pour s'occuper d'un sous-marin nucléaire soviétique abandonné près d'Hawaï. Il demande à son vieil ennemi, Wolverine, et à Tornade, la femme qui l'a récemment cryogénisé, de l'accompagner dans sa mission. Omega Red se voit offrir la possibilité de retrouver son humanité, mais une fois à bord du sous-marin rempli d'ogives nucléaires, il révèle ses véritables intentions, mortelles.