Nikita est renvoyée à la Section Un pour neutraliser une nouvelle menace terroriste qu'elle seule peut gérer : une réunion au sommet réunissant des représentants de plusieurs groupes terroristes. Elle fait équipe avec un nouvel agent de niveau 5, Marco O'Brien. O'Brien était le policier recruté quatre ans plus tôt à cause d'une erreur commise par Nikita, un fait qu'il n'a pas oublié. Nikita découvre qu'en plus des terroristes, elle doit composer avec O'Brien et l'hostilité d'une grande partie du personnel de la Section, en raison de son rôle dans l'évaluation de la Section par le Centre.