Michael et Nikita voyagent sans cesse, échappant toujours à la Section Un. Lorsque George est éliminé après avoir divulgué des informations à Cellule Rouge pour discréditer la Section Un, les Opérations, désormais renforcées, et Madeline retrouvent enfin la trace de Michael et Nikita et les ramènent à la Section. Au moment où leur mission est sur le point d'être annulée, tous les systèmes de la Section s'arrêtent brutalement. M. Jones, le mystérieux directeur du Centre, se rend à la Section Un pour procéder à une évaluation et a mis la Section en stase. À son arrivée, Jones se révèle être Nick Shtoppel, le voisin de Nikita et informateur de la Section. Il révèle que Nikita travaille secrètement pour le Centre depuis trois ans. Nikita aide Jones dans son évaluation, et la situation bascule. Les Opérations sont contraintes de rester à la Section Un pour les sept années suivantes. Madeline se suicide plutôt que d'être annulée. Walter est transféré à la Ferme, où il sera…