Et si oui, qu'adviendra-t-il de Michael, Nikita et Walter ? 318. Michael et Nikita sont envoyés en mission pour découvrir qui est impliqué dans une usine pharmaceutique appartenant à la société Genefex et qui est un fournisseur de Red Cell vendant également une arme biologique nommée Gandium. À leur insu, l'opération a un objectif secondaire : mettre un terme définitif à leur liaison. Une fois l'objectif de la mission atteint, Nikita est envoyée dans une autre partie de l'usine, où Madeline l'attend pour la « reprogrammer » et faire disparaître ses sentiments pour Michael. Pendant ce temps, le service des Opérations commet l'impensable : il met Walter à la « retraite ». Birkoff, cependant, a d'autres projets et s'empresse de saboter le remplaçant de Walter, un jeune homme innocent nommé Giles.