Asuka bashkohet me klasën e Shinji-t në shkollë dhe shpërngulet me Misaton dhe atë në apartamentin e tyre. Ndërsa Asuka përshtatet me Japoninë (ose më saktë, të gjithë të tjerët përshtaten me të...), sulmon një Engjëll i ri i cili është i aftë të ndahet në dy kopje identike. EVA-01 dhe EVA-02 mposhten dhe NERV poshtërohet publikisht. Me Engjëllin në një periudhë rigjenerimi njëjavore pas një sulmi në minën N² nga JSSDF, Asuka dhe Shinji duhet të mësojnë të "sinkronizojnë" lëvizjet e njëri-tjetrit në betejë, në mënyrë që ta mposhtin atë një herë e përgjithmonë.