La récente invasion des Nomades a dispersé la troupe MK vers l'extrême sud, laissant les jeunes vulnérables. Après la saison sèche, lorsque le niveau de l'eau baisse, Kimba et Maya, frère et sœur, risquent de traverser la rivière pour retrouver leurs parents. Ils affrontent les populations de crocodiles et d'hippopotames les plus denses d'Afrique et font face à une menace encore plus grande de l'autre côté.