Hondo, son père Daniel Sr. et Darryl, un adolescent dont il a la charge, sont confrontés à l'histoire des tensions raciales à Los Angeles entre les forces de l'ordre et la communauté noire, à travers des flashbacks sur la ville en 1992 après le verdict de l'affaire Rodney King. Par ailleurs, l'équipe du SWAT traque le cartel de la drogue d'El Diablo, dispersé dans la ville, et un groupe djihadiste qui commet des attentats coordonnés à la bombe.