Une erreur informatique provoque un dysfonctionnement des résultats du test de sciences à Kadic, et perturbe également le reste du système informatique. Jeremy est alerté de l'activation d'une tour et, avec Aelita, Odd, Ulrich et Laura, il se rend au laboratoire pour enquêter. Le père de Laura est convoqué à l'école suite à cette erreur et la rappelle au bureau du principal. Il lui fait part de ses doutes quant à ses capacités et souhaite qu'elle aille dans un autre établissement. Laura insiste pour rester et décide de lui montrer le Supercalculateur comme preuve de ses compétences. Pendant ce temps, les autres explorent Lyoko à la recherche de la tour activée, restée introuvable. Jeremy finit par la localiser dans le Cortex et les envoie sur place pour la neutraliser. À l'arrivée de Laura et de son père, Aelita retourne au laboratoire pour les faire sortir du chemin de Jeremy et permettre ainsi à ce dernier de mener à bien sa mission. La tour est désactivée et un voyage dans le passé est amorcé.