Nate est stupéfait d'apprendre qu'il possède des pouvoirs et se retrouve accidentellement avec Ray au Japon féodal. Sara, Vixen et Rory décident de retrouver Nate et de l'aider à maîtriser ses pouvoirs afin qu'il puisse défendre un village japonais contre le Shogun et une armée de samouraïs. Pendant ce temps, Jax et Stein restent sur place pour réparer le vaisseau et découvrent un compartiment secret, mais décident de garder leur découverte secrète.