Alors que Kuzco s'apprête à obtenir son diplôme, il doit visionner une vidéo d'orientation pour devenir Empereur. Cette vidéo le pousse à se demander s'il est capable de diriger son peuple et s'il souhaite réellement redevenir Empereur. Yzma, cherchant désespérément à l'empêcher d'obtenir son diplôme, décide de profiter de sa nouvelle insécurité. Elle lui donne une potion qui le transformera en poulet pour toujours. Il accepte la potion, s'enfuit et se retrouve par hasard dans une usine de fabrication de mugs à la viande Mudka. Yzma étant sur le point de devenir Impératrice, Kronk et Malina doivent retrouver Kuzco et le retransformer en humain afin qu'il puisse devenir Empereur.