Après avoir capturé Daniel et Arcee et récupéré la clé de la Chambre d'énergie plasma, Scorponok et les Decepticons se dirigent vers Cybertron. Les Autobots se lancent à leur poursuite, mais Spike et Cerebros restent sur Nebulos et élaborent une stratégie pour utiliser une cité-ruche comme arme contre Scorponok. Pendant ce temps, les Decepticons et Scorponok commencent à menacer la Terre et il revient aux Autobots et à leurs alliés de les arrêter.