Bien que le laboratoire soit fermé, le docteur Vindi parvient à activer le redoutable virus de l'Ombre Bleue, infectant Ahsoka, Padmé et de nombreux soldats clones. La peste est mortelle en 48 heures. Anakin et Obi-Wan doivent se rendre sur la mystérieuse planète Iego pour se procurer le seul antidote connu. À leur arrivée, ils découvrent une population terrorisée par une force mystérieuse qui élimine quiconque tente de quitter leur monde. Avec l'aide de Jaybo Hood, un jeune Iegoen débrouillard, Anakin et Obi-Wan doivent percer le mystère de la planète avant de pouvoir partir, et avant que tous les infectés par le virus séparatiste ne périssent !