La troisième saison de Falling Skies débute sept mois après l'arrivée de la 2e Division à Charleston. Entre-temps, Tom a été élu à un poste politique, mais il est débordé alors que la résistance continue de combattre les envahisseurs extraterrestres. La décision de Tom de faire combattre les Skitters rebelles aux côtés des humains crée des tensions et fait naître des soupçons : quelqu'un pourrait-il transmettre des secrets à l'ennemi ? De son côté, Hal est en proie à des cauchemars si réalistes qu'il a du mal à savoir s'il est éveillé ou en train de rêver. Et Tom et Anne se préparent à accueillir leur bébé.