Les stratégies de Lelouch donnent l'avantage aux Chevaliers Noirs et à leurs alliés dans leur bataille contre l'armée de Britannia. Alors que des émeutes éclatent dans tout le pays, les Chevaliers Noirs prennent le contrôle de l'Académie Ashford pour en faire leur quartier général, et les élèves sont épargnés sur ordre de Lelouch. Suzaku, fou de rage et informé de l'identité de Zero par un mystérieux jeune garçon nommé V.V., se lance à la poursuite de Lelouch pour se venger, une vengeance que Cornelia convoite également.