Les Tortues et leurs compagnons poursuivent leur entraînement auprès du Tribunal Ninja, apprenant à combattre dans les mondes physique, mental et spirituel. Ils auront besoin de ce savoir, car le second artefact du Shredder a été découvert, gardé par une horde de redoutables démons Tengu qui dévorent les Acolytes au petit-déjeuner… littéralement !