Sloane se retire temporairement de son poste de directeur de l'équipe spéciale et confie à Jack les pleins pouvoirs sur la prochaine mission, qui implique Anna Espinosa, l'ancienne ennemie de Sydney. Cependant, Anna prend l'avantage sur l'APO en capturant Nadia et en forçant Sydney à obéir à ses ordres. Sydney révèle à Nadia la prophétie des Rambaldi, selon laquelle deux sœurs s'affronteront et une seule survivra. Pendant ce temps, Vaughn rend visite à Sark et tente de le convaincre de les aider à capturer Anna. Finalement, l'une des sœurs est mortellement blessée par Anna. 169.