Le plan catastrophique de Rambaldi commence à se mettre en place lorsqu'une version géante du dispositif Circumference/Mueller est découverte flottant au-dessus d'une ville russe, semant la terreur parmi ses habitants. Après que Dixon, blessé, révèle qu'Irina est vivante, Sydney, Nadia et Jack partent à sa recherche. Irina avait été capturée, puis dupliquée grâce au Projet Helix, afin de faire croire à sa mort. Sydney et Nadia découvrent qu'Irina est retenue prisonnière dans un camp à Tikal, en sécurité entre les mains de l'armée d'Elena. Apparemment, Irina œuvrait pour contrer l'organisation d'Elena, l'Alliance, et pour empêcher le plan final de Rambaldi. Irina raconte l'histoire d'une page qu'elle a détruite, une page clé pour le plan de Rambaldi. Sous la torture, elle a fini par craquer et la recréer pour Elena. Après une courte pause, le transport se dirige vers la Russie, et Sydney, Vaughn, Jack, Nadia et Irina sautent en parachute, en direction d'Elena, Sloane, du Circumference... et du destin.