Sydney tente de reconstituer les deux dernières années de sa vie et découvre le sort de ses amis et de sa famille. Elle confronte Vaughn au sujet de son mariage et apprend la terrible nouvelle concernant Jack et Sloane. Parallèlement, elle obtient une habilitation de sécurité temporaire de la CIA pour une affaire qui pourrait l'aider à recouvrer la mémoire.