Un vieux scientifique sollicite l'aide des ThunderCats pour sauver les océans de la Troisième Terre. Jadis, une fissure s'est formée au fond de l'océan, provoquant une infiltration d'eau dans le noyau terrestre. Le docteur Dometone a créé un bouchon qui a scellé la brèche et sauvé la Troisième Terre de la destruction. Aujourd'hui, un mineur maléfique, Scrape, est venu retirer le bouchon et exploiter la roche gisant au fond de l'océan. Les ThunderCats rejoignent le docteur Dometone et son robot à l'apparence de grenouille, Herkie, pour sauver la planète de la destruction totale.