L'épisode commence avec un navire en difficulté. Un télescope se brise, libérant un homme. Sur le quai de San Francisco, un homme surgit de la brume et entre dans un bar. Il se tient dans une flaque d'eau qui gèle, le bar se fige à son tour, il crie « Carolyn » puis s'effondre. Il est transporté à l'hôpital local. Là, les machines et les lits d'hôpital se figent. Une sorte de mini-séisme se produit. Rachel arrive à l'hôpital pour l'examiner. Le médecin lui montre un livre qu'il avait sur lui, un ouvrage du XIXe siècle en parfait état. Rachel le rencontre brièvement, mais il s'échappe. Il sort en courant de l'hôpital et aperçoit un bateau miniature dans la vitrine d'un magasin. Il commence alors à avoir des visions du navire en difficulté du début de l'épisode. Rachel et Alex se rendent au quai/bar où cet homme s'est effondré. Une autre secousse sismique se produit ; Rachel sait qu'il est tout près. Ils le rejoignent et Rachel lui dit qu'elle va l'aider à se souvenir de son passé. Ils l'appellent John Doe.