Quelques minutes après son décollage de l'aéroport JFK de New York, le vol 800 de la TWA est ravagé par une violente explosion. Face à la possibilité d'un attentat terroriste, le FBI se joint aux enquêteurs du NTSB pour mener une enquête urgente. Les deux agences espèrent des résultats rapides, mais l'enquête sur le vol 800 de la TWA finira par les opposer et deviendra l'une des plus longues, des plus coûteuses et des plus complexes jamais menées.