Le groupe a prévu une mission de collecte de données de routine dans le Cortex. Cependant, Ulrich se retire de la mission lorsqu'il découvre que Yumi a écrit des choses négatives à son sujet. Attaquée par des ninjas dans le Cortex, Yumi ne cesse de penser à Ulrich. Elle se fait dévirtualiser volontairement pour aller lui parler et arranger les choses. Ils se réconcilient rapidement. Pendant ce temps, un ninja, ayant survécu au combat dans le Cortex, suit le Megapod jusqu'au Skid, puis s'accroche à celui-ci jusqu'au hangar du Secteur Cinq. William se retrouve seul face au ninja, qui se dirige vers le Cœur de Lyoko. Ulrich est appelé en renfort et détruit facilement le ninja avec ses sabres laser, mais celui-ci dépose un dispositif inquiétant sous une plateforme du Secteur Cinq avant de disparaître.