Le corps du soldat clone Tup doit être transporté sur Coruscant, où les médecins du Chancelier Palpatine l'examineront de près. Le soldat ARC Fives enfreint le protocole et désobéit aux ordres pour trouver des réponses. Il découvre alors une structure organique à la fonction inconnue, dissimulée dans le cerveau de tous les soldats clones.