Mulder reçoit un tuyau sur des opérations paramilitaires potentiellement dangereuses sur le sol américain, mais lors de l'opération d'infiltration, il découvre avec surprise l'identité de son informateur : Alex Krycek. Méfiant quant à ses véritables intentions, Mulder suit à contrecœur les informations fournies par Krycek. Cependant, il découvre bientôt un complot bien plus vaste qui le conduit dans un goulag de la Toungouska, en Russie, où des prisonniers sont utilisés pour des expériences impliquant une substance d'origine extraterrestre.