Lorsque Dib parvient enfin à prendre une photo de Zim sans qu'il soit déguisé, Zim élabore un plan : il doit se miniaturiser à une taille microscopique pour entrer dans le corps de Dib et lui effacer la mémoire afin qu'il ne se souvienne plus où il a trouvé la photo. Heureusement pour Dib, son père travaille sur une technologie qui pourrait bien l'aider à arrêter Zim avant qu'il ne soit trop tard. Il devra cependant être très prudent, car il est extrêmement vulnérable, Zim étant à l'intérieur de lui.