Spider-Man apprend que le Bouffon Vert projette de parcourir le Multivers grâce au Siège Périlleux qu'il a dérobé au S.H.I.E.L.D. et à l'énergie d'Electro afin de collecter l'ADN d'autres Spider-Men. Spider-Man poursuit son ennemi dans le monde futuriste de Marvel 2099 (dessiné en images de synthèse) et aide Spider-Man 2099 à reprendre confiance en lui. Il se rend ensuite dans un univers où les genres sont inversés et fait équipe avec Spider-Girl pour vaincre les versions locales du Bouffon Vert.