Alors que la Seconde Guerre mondiale touche à sa fin, une base sous-marine nazie secrète est endommagée lors d'une bataille navale. Un scientifique nazi et son assistant sont accidentellement placés en animation suspendue. Trente-cinq ans plus tard, l'équipage du Seaview les découvre et les réveille. Les nazis tentent alors de mener à bien leur mission interrompue : détruire les capitales des Alliés.