Le forage imprudent de Hacker sur Ecotopia a déclenché un geyser de slime, détruisant l'habitat de nombreux animaux. Après avoir fait équipe avec Ollie (interprété par Rico Rodriguez) pour rétablir l'harmonie, la CyberSquad découvre que sauver les animaux n'est pas leur seul problème. La mère d'Ollie a également disparu. De vieux amis et d'anciens ennemis refont mystérieusement surface au fil de l'histoire. Les enfants parviendront-ils à restaurer Ecotopia, à sauver leurs amis et à empêcher le Cyberespace de tomber à jamais entre les mains du maléfique Hacker ?