MacGyver et Pete testent un nouveau système de sécurité à l'Administration de la Recherche et du Développement Stratégique. MacGyver parvient à contourner la sécurité et rencontre le Dr Jill Ludlam, la conceptrice du système. Elle tente de désactiver le système, mais celui-ci ne réalise pas qu'il s'agissait d'un simple test. MacGyver et le Dr Ludlam sont alors contraints de trouver une issue, tandis que le système de sécurité, nommé Sandy, tente de détruire les « intrus ».