Dans le premier épisode de la sixième saison, les habitants de Tree Hill doivent prendre une décision qui changera leur vie à jamais. Lucas réalise enfin son rêve avec la femme qu'il aime, Brooke doit affronter ses retrouvailles avec sa mère, Mouth fait une révélation, Nathan et Haley doivent faire face à un fantôme de leur passé et la nouvelle de l'accident de Dan commence lentement à se répandre.