La voix provenant du Shinkansen Noir, le « Shinkalion Fantôme », est celle d'Ina, disparue. Taisei est si choqué que son Aptitude chute et il est incapable de piloter le Shinkalion. Tandis qu'Akane, Ryota, Ten et Shion partent à la conquête des Inconnus apparus à travers le pays, Taisei, dont l'Aptitude n'est pas encore rétablie, se retrouve piégé dans le Métavers. Soudain, une personne apparaît devant lui.