Max commence à développer d'étranges marques sur son corps alors qu'elle mène une résistance transgénique contre White, qui tente de capturer l'un de ses « frères ». Cependant, les transgéniques sont stupéfaits par les secrets révélés concernant leur « père », qui remettent en cause toutes leurs convictions et soulèvent de nombreuses questions. Pendant ce temps, les habitants de Terminal City organisent une campagne pour combattre les humains qui les traquent, et Alec découvre pourquoi Logan s'est éloigné de ses anciens amis. 346.