Le Fantôme de la Boîte, l'un des fantômes les plus faibles de la Zone Fantôme, attaque avec toutes les « boîtes mortelles » qu'il possède dans le monde des humains, mais Danny le vainc facilement. Il élabore alors un plan : utiliser la « Boîte de Pandore », la boîte la plus puissante jamais créée, et se servir des pouvoirs maléfiques et mortels qu'elle renferme pour attaquer Amity Park. Danny doit maintenant trouver la seule personne capable de le sauver : Pandore elle-même !