Sydney doit prendre une décision cruciale concernant son avenir au sein de l'agence, tandis que Sloane refait surface et poursuit sa quête obsessionnelle pour reconstituer le puzzle des mystérieux artefacts Rambaldi, avec l'aide, bien malgré elle, d'un scientifique kidnappé. Pendant ce temps, le mariage de Dixon est mis à rude épreuve lorsqu'il révèle à sa femme la vérité sur sa profession.