Jack Bauer affronte les éléments et continue de se battre pour empêcher une attaque qui pourrait bouleverser le pays à jamais. Alors que le coup fatal porté à la nation se rapproche, Tony Almeida opère depuis le terrain et Kim Bauer, que l'on a vue pour la dernière fois dans la saison 5, fait son retour. Parallèlement, la situation se complique lorsque l'administration est confrontée à une tentative de chantage.