Les Mysterons ressuscitent le capitaine Black, qui prend le contrôle d'une société de distribution internationale et d'un chef militaire russe. Avec ce dernier, ils lancent une attaque massive contre Skybase, tandis qu'avec la première, ils transportent en Sibérie suffisamment de matières nucléaires pour fabriquer une bombe capable de raser la planète. Pendant ce temps, le capitaine Scarlet, redevenu lui-même, doit regagner la confiance du capitaine Blue pour collaborer avec lui et arrêter le capitaine Black. Pendant ce temps, l'ancienne amante de Black, Destiny Angel, doit se faire à l'idée que l'homme qu'elle a aimé est désormais allié à l'ennemi.