L'enlèvement d'un architecte américain à Rome semble lié à une menace terroriste grandissante à New York. Jubal et Nina, du FBI, rejoignent Forrester et son équipe Fly en Italie pour retrouver l'Américain disparu et identifier la cible américaine des terroristes. Ce crossover se poursuit dans FBI S05E17 Menace imminente (II) et FBI : Most Wanted S04E16 Menace imminente (III).