2003. Alors qu'une épidémie fongique parasitaire ravage le pays et le monde, Joel Miller tente de fuir le chaos grandissant avec sa fille et son frère. Vingt ans plus tard, Joel, désormais endurci, et sa partenaire Tess luttent pour survivre sous un régime totalitaire, tandis que les Lucioles, un groupe insurgé, abritent une adolescente dotée d'un don unique.