Déterminée à récupérer William, Scully décide d'agir elle-même lorsque les tentatives du FBI pour l'aider dans l'enquête se révèlent peu fructueuses. Avec l'aide des Lone Gunmen, elle découvre des informations terrifiantes sur les ravisseurs de son enfant et se retrouve une fois de plus confrontée au mystère entourant l'intérêt sinistre porté à son fils.