Kouzou Fuyutsuki rrëmbehet dhe merret në pyetje nga Seele, të cilët janë të tmerruar nga rezultatet e takimit të fundit me një Engjëll. Ai rrëfen të kaluarën e tij, duke ofruar rikthime në krijimin e Nerv. Zbulohen gjithashtu të kaluarat e Misato Katsuragi, Ritsuko Akagi, Rei Ayanami dhe Yui Ikari. Ndërkohë, Ryouji Kaji vendos të zbulojë të vërtetën, pavarësisht kostos.