Marie Belle Breguet, një inxhiniere gjeniale e 'Meister Guild', u dërgua për të hetuar anomalinë e Kullës Qendrore të Kiotos, por për të zbuluar lëvizjen e dyshimtë të ushtrisë. Ndërkohë, Crown erdhi në shkollën e mesme Naoto si një nxënëse transferimi. Shkolla po bën bujë për kombinimin e NaoTou dhe kushëririt Bishojo!