Një shpërthim misterioz shkatërron X-Mansion pikërisht në momentin që Wolverine po largohej. Profesori X dhe Jean Grey mungojnë dhe ndoshta janë zhdukur përgjithmonë duke bërë që X-Men të shpërbëhen. Megjithatë, një vit më vonë, Anti-Mutanti gjuan Wolverine dhe arreston një familje që e ndihmoi, duke e detyruar atë të shkojë pas tyre me ndihmën e Beast. Brenda burgut, ata lirojnë të gjithë mutantët, përfshirë Dust, Boom Boom dhe Pyro. Në fund, Wolverine vendos të gjejë X-Men-ët e tjerë dhe të luftojë Anti-Mutantët.