Dhjetë vjet më parë në qytetin Fuyuki, një djalë i vogël u përfshi nga një zjarr i madh që i dogji prindërit dhe përfshiu një pjesë të madhe të qytetit; ndërsa po vdiste, një burrë e shpëton. Tani ky djalë, Shirou Emiya, është një mekanik amator që ndjek shkollën në Homurabara Gakuen. Shirou gjithashtu duket të jetë një magjistar mjaft i mirë, por aftësitë e tij nuk janë aspak afër nivelit të babait të tij të ndjerë. Ndërkohë, qyteti po fillon të pllakoset nga derdhjet e gazit dhe vrasjet dhe me ndjenjën e drejtësisë së Shirou-t që fillon të veprojë, çfarë mund të bënte dikush si ai?