Kur një organizëm misterioz alien merr Dr. Jennifer Keller si strehuesen e tij, Dr. Carson Beckett i ringjallur rishtas dhe ekuipazhi kërkojnë me dëshpërim një serum për ta shpëtuar atë nga ndërhyrësi në zhvillim përpara se ai të mund të depërtojë në Atlantis. Ndërkohë, Richard Woolsey zyrtarisht i bashkohet ekipit, pasi është zgjedhur si zëvendësues i Kolonel Samantha Carter për të udhëhequr ekspeditën e Atlantis.