Pas Impaktit të Dytë, qeniet gjigante të quajtura Engjëj sulmojnë Tokio-3 me qëllimin e dukshëm për të shkatërruar njerëzimin. Shinji i ri rekrutohet për të pilotuar një njësi misterioze Evangelion dhe për t'i luftuar ata në këtë riimagjinim të gjashtë episodeve të para të serialit anime, të publikuara më vonë në versionet e zgjeruara 1.01 dhe 1.11.

Aktorët

• Megumi Ogata — Shinji Ikari (zëri)
• Megumi Hayashibara — Rei Ayanami / Yui Ikari (zëri)
• Kotono Mitsuishi — Misato Katsuragi (zëri)
• Yuriko Yamaguchi — Ritsuko Akagi (zëri)
• Akira Ishida — Kaworu Nagisa (zëri)
• Fumihiko Tachiki — Gendo Ikari (zëri)
• Motomu Kiyokawa — Kozo Fuyutsuki (zëri)
• Miki Nagasawa — Maya Ibuki (zëri)