Nous sommes en 1988. Le psychiatre Tom Allen se remet difficilement du décès de sa femme et d'une liaison tragique avec Alice. La disparition d'un garçon à l'école catholique locale soulève de nombreuses questions au sein de la communauté. Deux membres du clergé populaires, le père Andrassi et le frère Warner, se lancent dans des recherches intensives pour retrouver l'enfant. Mais l'Église est également confrontée à des problèmes moraux internes, et Tom est appelé à conseiller plusieurs prêtres aux prises avec des difficultés personnelles. Alors que le cardinal Neville s'apprête à prendre sa retraite, son mandat est salué par la députée Margaret Wallace, mais une lutte s'engage déjà pour le poste suprême de l'archidiocèse de Sydney.