Le Pingouin règne sur Gotham et, après un remaniement au sein du GCPD, le sens moral du détective James Gordon vacille, et il sollicite l'aide du Pingouin. De son côté, Bruce Wayne poursuit son enquête sur les secrets du bureau de son père, et Theo Galavan et sa sœur, Tabitha, nouveaux venus à Gotham, se lient d'amitié avec des alliés improbables : un groupe de dangereux détenus d'Arkham.