Sur un bateau en route pour visiter les ruines dédiées à Reshiram, Sacha, Iris et Rachid rencontrent un mystérieux garçon se faisant appeler N, qui se lie rapidement d'amitié avec leurs Pokémon. Cependant, lorsque la Team Rocket attaque à nouveau le groupe et que le Gaulet de James paralyse Pikachu avec Spore Paratonnerre, l'intervention opportune de N permet de renverser le cours du combat.