Le nouveau directeur adjoint Kersh organise une chasse à l'homme contre Mulder et confie la direction de l'équipe à l'agent John Doggett. Scully et Skinner participent à l'enquête, mais Kersh les avertit qu'ils seront renvoyés s'ils évoquent l'existence d'extraterrestres. Scully, avec l'aide des Lone Gunmen, suppose que le chasseur de primes tente d'effacer toute trace d'enlèvements et comprend qu'il pourrait s'en prendre à Gibson Praise, qui vit désormais dans un internat en Arizona. L'agent Doggett arrive à la même conclusion et son équipe se lance dans une course contre la montre avec Scully et Skinner jusqu'à l'internat, où ils surprennent Mulder en train de tenter d'enlever Gibson.